萬福庵位于今日的臺南市中區(qū)民族路二段317巷5號，原為明鄭成功部將阮駿的府邸。建于明永歷年間，列為三級古跡。明永歷十年丙申(西元1858年)阮駿鎮(zhèn)守舟山，但誤中敵計因此陣亡，三年后，阮駿夫人與明宗室后裔、遺老等隨鄭經(jīng)來臺，定居于寧靖王府一元子園后方，以頌經(jīng)禮佛、吃齋修行終其一生。死后，將其居所改為「阮夫人寺」，清嘉慶11年重修，改稱「萬福庵」。 目前的照墻外飾以白灰粉刷，破壞了古跡。廟內(nèi)保存著道光22年「感應(yīng)昭誠」匾一乃，嘉慶8年，林朝英題的三塊匾額等都是重要的歷史文物。 民國61年，改建為二樓新式廟宇，只有照墻仍為建筑舊物，具保存價值。民國80年曾重修，因照墻仍為建筑舊物，所以仍有保存的價值。
