建于1965年，前臨光華島，后依青龍山，為一仿唐式建筑。該寺地理風(fēng)水稱該寺占“青龍戲珠”寶地，廟分兩層，分別供奉玄奘舍利子與釋迦牟尼佛金身。
玄奘為唐朝高僧，受唐太宗之命前往印度取經(jīng)，經(jīng)十余年返國，得經(jīng)書六百五十余部，與其弟子共譯七十五部，得一千三百三十五卷，對佛教在中國的發(fā)展貢獻卓著。中日戰(zhàn)爭期間，日人在南京掠走玄奘大師的靈骨，供奉在日本琦玉縣慈恩寺，1955年，始迎靈骨回國，供奉于日月潭畔之玄光寺，1965年11月，玄奘寺建成后，靈骨才遷迎入。
玄奘寺正方形的地磚散發(fā)著光滑與樸實感。寺內(nèi)“國之環(huán)寶”匾額乃先總統(tǒng)蔣公親題，寺外墻上，刻有玄奘西域游行圖與碑文三座；左為中日親善紀念，中有玄奘法師傳記，右則中日佛教親善交流紀念碑。此外，門前尚有兩尊石象，殿前有大鼓一座，登梯而上可見供人敲槌之醒鐘。
