位于馬公鎮(zhèn)東郊，是清代以前澎湖唯一的學府。1766年（清乾隆三十一年）冬，貢生許應元在此提倡儒學，選育人才，并募款興修學府，取名為“文石書院”。書院里原陳列圖書史冊極多，堂中祀奉文昌帝像以及朱熹、程顥、程頤、周敦頤、張載等五位宋代理學大師。當時書院擔負著興盛儒學的重任，是澎湖文化的發(fā)源地。中法戰(zhàn)爭時，書院被法軍付之一炬。日據日期，這里改祀孔子，成為孔廟。
目前建于文石書院遺址上的孔廟，是60年代修造的。前為大成殿及圣祠，后為文昌祠，右側是古老的登瀛樓，為文石書院遺跡，門庭秀雅，頗有書香氣息。登樓憑欄遠眺，可見澎湖灣碧波萬頃，白浪滔滔。附近還有記載著書院建立和整個澎湖列島開發(fā)歷史的石碑兩塊，極具研究價值。
