臺(tái)南市民族文物館隸屬于臺(tái)南市民政局,并附屬于臺(tái)南市延平郡王祠內(nèi)。文物館的前身為“臺(tái)灣史料館”,創(chuàng)始于1932年4月1日,館址設(shè)在安平古堡,保存早期的臺(tái)南鄉(xiāng)土資料和歷史文物。1937年遷移至赤坎樓,以文昌閣為第一展室,陳列史前、荷據(jù)、明鄭等時(shí)代的文物資料;以南海神廟為第二展室,專(zhuān)門(mén)陳列清代史跡之物。1963年易名“臺(tái)南市民族文物館”。1965年,各界民眾集資修建延平王祠時(shí),為紀(jì)念鄭成功的豐功偉績(jī),決定將民族文物館遷入。1975年,臺(tái)南市政府為舉辦觀光年,大量搜集先民遺留的文物史料,充實(shí)陳列內(nèi)容,并將原有陳列室擴(kuò)建成四室。