位于澎湖縣立文化中心附近，為清朝時(shí)代文石書院之所在地，建于清乾隆32年，是當(dāng)時(shí)澎湖唯一的學(xué)校，因?yàn)椴捎门旌?dāng)?shù)靥禺a(chǎn)的文石所砌成，故稱為文石書院，后經(jīng)光緒11年中法戰(zhàn)爭的破壞，日據(jù)時(shí)代整修后改祀孔子，1962年重建，即成今之孔廟。
今僅存登瀛樓為文石書院遺構(gòu)，其門墻、窗欞、檐角都極其精致；古色古香極富中國傳統(tǒng)氣息，登樓展望極佳?？讖R無管理人員編制，平時(shí)并不開放，只有在每年教師節(jié)祭孔大典上，孔廟才開放供人參觀。
