鳳山國家地質公園博物館位于中國第五大洞穴廳堂穿龍巖內，占地4200平方米，空間高度達100米，是我國目前利用天然洞穴建設的空間最大、鐘乳石展品最多、格局最美、展示最奇特的地質博物館，館內設了圖文燈箱展區(qū)、實物展區(qū)、科普演示及游客服務區(qū)、沙盤模型展區(qū)、鳳山旅游商品及水景區(qū)共五個展區(qū),在布展風格上把洞穴原生態(tài)和現(xiàn)代展覽技術各種元素有機結合，突出色彩、燈光與洞穴的和諧;在布展內容上除原址遺留的地質遺存物，還收集了鳳山國家地質公園其他景區(qū)以及全國各地的典型地質遺跡標本，是個典型的大型巖溶洞穴地質博物館。
