由于波斯尼亞的人口結(jié)構(gòu)由波斯尼亞大多數(shù)人的混合人口、塞族和克羅地亞少數(shù)民族組成，波斯尼亞大面積地區(qū)的所有權(quán)存在爭議。

從1991年到1992年，多民族波斯尼亞和黑塞哥維那的局勢變得緊張。它的議會在種族方面分散為多個波斯尼亞派和少數(shù)塞族和克羅地亞派別。1991年，塞爾維亞民主黨最大的塞族派系領(lǐng)導人拉多萬·卡拉季奇向波斯尼亞議會發(fā)出嚴厲直接的警告，如果它決定分開，他說：

這，你所做的，并不好。這條路是你想帶波斯尼亞和黑塞哥維那走的，就像斯洛文尼亞和克羅地亞走的一樣。不要以為你不會把波斯尼亞和黑塞哥維那帶進地獄，穆斯林可能會滅絕。因為如果這里有戰(zhàn)爭，穆斯林人民就不能自衛(wèi)。

與此同時，在幕后，米洛舍維奇和圖曼之間開始談判，將波斯尼亞和黑塞哥維那分為塞族和克羅地亞管轄地區(qū)，以試圖避免波斯尼亞克族人和塞爾維亞人之間的戰(zhàn)爭。波斯尼亞塞族人于1991年11月舉行全民投票，結(jié)果以壓倒性的票數(shù)贊成與塞爾維亞和黑山保持共同的狀態(tài)。

在公開場合，塞爾維亞的親州媒體向波斯尼亞人宣稱，波斯尼亞和黑塞哥維那可以在新的南斯拉夫民主政府的基礎(chǔ)上成為一個新的自愿聯(lián)盟，但波斯尼亞和黑塞哥維那政府并沒有認真對待這一點。

1992年1月9日，波斯尼亞塞族議會宣布獨立的波斯尼亞和黑塞哥維那塞族人民共和國（即將成為斯普斯卡共和國），并在整個州內(nèi)建立了塞爾維亞自治區(qū)（SAR）。波斯尼亞和黑塞哥維那政府宣布塞爾維亞關(guān)于留在南斯拉夫的公民投票和特區(qū)的建立違憲。

1992年2月29日和3月1日舉行了由波斯尼亞政府主辦的關(guān)于獨立的公民投票。聯(lián)邦憲法法院和新成立的波斯尼亞塞族政府宣布全民投票違反波斯尼亞和聯(lián)邦憲法，并且在很大程度上抵制了公民投票。波斯尼亞塞族人。根據(jù)官方結(jié)果，投票率為63.4％，99.7％的選民投票支持獨立。目前還不清楚三分之二的多數(shù)要求實際上意味著什么，是否得到滿足。

波斯尼亞和黑塞哥維那于1992年3月3日宣布獨立，并于1992年4月6日在獲得國際承認。在同一天，塞族人宣布塞族共和國獨立，并圍攻薩拉熱窩，這標志著波斯尼亞戰(zhàn)爭的開始。波斯尼亞和黑塞哥維那共和國隨后于1992年5月22日被接納為聯(lián)合國會員國。